根據衛生局的統計，9月20日起，我省新農村合作醫療體系重大疾病覆蓋范圍已包括苯丙酮尿癥等15種兒童重大疾病。這些新疾病是14歲以下兒童的常見疾病。

當時，我省新型農村合作醫療保險疾病總數達到35種，居全國前列。15種新的主要疾病是苯丙酮尿癥、雙側重度感音神經性耳聾、尿道下裂、先天性幽門肥厚性狹窄、髖關節發育性脫位、脊髓栓系綜合征（脊髓脊膜膨出）和9種復雜的先天性心臟病（完全心內膜墊缺損、部分心內膜墊缺損、主動脈瓣狹窄）。無反射，法洛四聯癥，房間隔缺損綜合征）。室間隔缺損、室間隔缺損伴右心室流出道狹窄、室間隔缺損伴動脈導管未閉、室間隔缺損、動脈導管未閉伴肺動脈瓣狹窄、心房和室間隔缺損伴動脈導管未閉。

按照規定，省、市醫療機構范圍內的這15種住院患兒的實際醫療費用，分別按65%和70%的比例由新農村合作醫療基金補償；門診按實際醫療費用的80%補償。對限額內的藥品實行統一補償，不設起訖線，不受《基本藥品目錄》限制。此外，對民政部門認定的大病困難兒童，還將在新農合補償基礎上，由當地民政部門再按住院和門診費用的15%予以救助。這意味著，患苯丙酮尿癥困難兒童報銷比例可達到限額內實際醫療費用的95%，患其他門診救治病種的困難兒童報銷比例最高可達到限額內實際醫療費用的85%。