城鎮職工醫療保險、城鎮居民醫療保險和新型農村合作醫療是全民醫保的三駕馬車。醫療保險與醫療保險的主要區別在于：面對不同的人群，健康保險主要面向老年人、嚴重殘疾者、學生、兒童和其他非從業人員。職工醫療保險主要面向工作單位、個人職工和離退休人員。居民醫保繳費標準總體上低于職工醫保，在個人繳費基礎上財政給予適當補貼，職工醫保由用人單位和職工個人共同繳納，不享受財政補貼；職工醫保設立個人賬戶，即門診賬戶，居民醫保不設個人賬戶；居民醫保由于籌資水平較低，醫療待遇標準總體上低于職工醫保；職工醫療保險設立最低繳費年限，達到繳費年限（20年)的，退休后不再繳費即可享受基本醫療保險待遇，而居民醫療保險不設立最低繳費年限，必須每年繳費，不繳費不享受醫保待遇。如果已經參加職工醫保，不能參加居民醫保。

城鎮居民從居民醫療保險中退出，參加城鎮職工基本醫療保險。他們不再享受城鎮居民醫療保障待遇，原有的繳費不予返還。城鎮居民醫療保險的年齡不計入城鎮職工醫療保險繳費年限。靈活就業人員退出城鎮職工基本醫療保險，參加城鎮居民醫療保險的，不計算城鎮職工基本醫療保險連續繳費年限，再次參加城鎮職工基本醫療保險的，視同首次參加。