基本醫療保險費用的結算方式，應根據社會保險經辦機構的管理能力以及定點醫療機構的不同類別確定，可采取總額預付結算、服務項目結算、服務單元結算等方式。也可以多種方式結合使用。
采取總額預付結算方式的，要根據基本醫療保險的給付范圍和參保人員的年齡結構，合理確定對定點醫療機構的預付總額。同時，要通過加強監督檢查，防止為降低醫療成本而減少必需的醫療服務，確保參保人員獲得基本醫療保險規定的、診療疾病所必需的、合理的醫療服務。
采取服務項目結算方式的，要根據醫療服務的收費標準和基本醫療保險服務管理的有關規定以及服務數量等進行結算。同時，要加強對醫療服務項目的監督和審查工作，防止發生大額處方、重復檢查、延長住院、分解診療服務收費等過度利用醫療服務的行為。
醫療保險費用結算采取哪些方式 ？
（一）門診大病（第一類）綜合醫療保險門診、定點零售藥店一般基本醫療費用和地方補充醫療費用按服務項目結算；
（二）住院醫療保險、農民工醫療保險門診基本醫療費用按綁定參保人數定額包干；
（三）門診大型醫療設備檢查和治療費用按核定的門診次均費用償付標準結算；
（四）門診血透基本醫療費用和地方補充醫療費用按有關協議規定的費用償付標準總額結算；
（五）生育醫療保險參保人產前檢查的基本醫療費用按服務項目結算；
（六）一般住院基本醫療費用和地方補充醫療費用按服務單元并結合住院門診人次比標準結算；
（七）部分病種或治療項目的住院基本醫療費用和地方補充醫療費用按病種費用償付標準結算；
（八）長期住院的精神分裂癥病人的住院基本醫療費用和地方補充醫療費用按年度包干結算；
（九）參保人住院發生的基本醫療保險、地方補充醫療保險費用超過醫院住院平均費用償付標準4倍以上的，單獨償付，其中90%按服務項目結算，10%按服務單元結算;醫院住院平均費用償付標準4倍以下的費用，按服務單元結算；
（十）其他費用結算按協議約定的方式結算。
采取服務單元結算方式的，可以診斷病種、門診診療人次和住院床日等作為結算的服務單元。具體結算標準可按同等醫療機構的服務單元的平均消費剔除不合理因素后確定，并根據物價指數進行適時調整。同時，要加強基本醫療保險管理和費用審核，防止出現推諉病人、分解服務次數等現象。
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